Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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