Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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UBE3CQ15386 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
UBE3CQ15386 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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