Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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BRD3Q15059 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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BRD3Q15059 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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BRD3Q15059 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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BRD3Q15059 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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BRD3Q15059 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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BRD3Q15059 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BRD3Q15059 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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