Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LAPTM4AQ15012 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LAPTM4AQ15012 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LAPTM4AQ15012 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LAPTM4AQ15012 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LAPTM4AQ15012 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LAPTM4AQ15012 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LAPTM4AQ15012 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LAPTM4AQ15012 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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LAPTM4AQ15012 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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LAPTM4AQ15012 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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