Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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