Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms