Protein–RNA interactions for Protein: Q14019

COTL1, Coactosin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COTL1Q14019 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms