Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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C1orf61Q13536 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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C1orf61Q13536 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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C1orf61Q13536 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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