Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PMS2P3Q13401 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms