Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLD1Q13393 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms