Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SGCGQ13326 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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