Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME3Q13232 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME3Q13232 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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