Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTP4A2Q12974 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTP4A2Q12974 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTP4A2Q12974 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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PTP4A2Q12974 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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PTP4A2Q12974 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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