Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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