Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABPB1Q06547 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms