Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms