Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms