Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms