Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL8P80075 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL8P80075 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL8P80075 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL8P80075 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL8P80075 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL8P80075 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL8P80075 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL8P80075 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms