Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms