Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms