Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTBP60709 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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