Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB15P59190 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB15P59190 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB15P59190 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB15P59190 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB15P59190 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB15P59190 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB15P59190 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB15P59190 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB15P59190 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms