Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN8P56748 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms