Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNTBP49356 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
FNTBP49356 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNTBP49356 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNTBP49356 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNTBP49356 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNTBP49356 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNTBP49356 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTBP49356 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNTBP49356 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNTBP49356 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNTBP49356 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNTBP49356 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNTBP49356 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNTBP49356 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FNTBP49356 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNTBP49356 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNTBP49356 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNTBP49356 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNTBP49356 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNTBP49356 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNTBP49356 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNTBP49356 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNTBP49356 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNTBP49356 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNTBP49356 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNTBP49356 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FNTBP49356 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNTBP49356 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FNTBP49356 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNTBP49356 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNTBP49356 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNTBP49356 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms