Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPIAP49247 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPIAP49247 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPIAP49247 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPIAP49247 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPIAP49247 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPIAP49247 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPIAP49247 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPIAP49247 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPIAP49247 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPIAP49247 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPIAP49247 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPIAP49247 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPIAP49247 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPIAP49247 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPIAP49247 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPIAP49247 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPIAP49247 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPIAP49247 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPIAP49247 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPIAP49247 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPIAP49247 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms