Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NESP48681 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NESP48681 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NESP48681 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NESP48681 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NESP48681 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NESP48681 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NESP48681 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NESP48681 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NESP48681 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NESP48681 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NESP48681 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NESP48681 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NESP48681 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NESP48681 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NESP48681 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NESP48681 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NESP48681 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NESP48681 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NESP48681 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NESP48681 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NESP48681 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NESP48681 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NESP48681 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NESP48681 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NESP48681 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NESP48681 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NESP48681 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NESP48681 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NESP48681 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NESP48681 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NESP48681 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NESP48681 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NESP48681 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NESP48681 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NESP48681 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NESP48681 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NESP48681 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NESP48681 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NESP48681 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NESP48681 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NESP48681 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NESP48681 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NESP48681 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NESP48681 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NESP48681 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NESP48681 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NESP48681 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NESP48681 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NESP48681 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms