Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms