Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms