Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIA1P42261 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms