Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MMP12P39900 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MMP12P39900 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP12P39900 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP12P39900 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP12P39900 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP12P39900 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP12P39900 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP12P39900 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP12P39900 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP12P39900 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP12P39900 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP12P39900 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP12P39900 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP12P39900 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP12P39900 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms