Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GGCXP38435 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GGCXP38435 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GGCXP38435 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GGCXP38435 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GGCXP38435 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GGCXP38435 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GGCXP38435 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GGCXP38435 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GGCXP38435 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GGCXP38435 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GGCXP38435 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GGCXP38435 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GGCXP38435 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GGCXP38435 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GGCXP38435 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GGCXP38435 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GGCXP38435 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GGCXP38435 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GGCXP38435 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GGCXP38435 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GGCXP38435 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GGCXP38435 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GGCXP38435 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GGCXP38435 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms