Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms