Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms