Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMO2P25791 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
LMO2P25791 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMO2P25791 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMO2P25791 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMO2P25791 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMO2P25791 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMO2P25791 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMO2P25791 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMO2P25791 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMO2P25791 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMO2P25791 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMO2P25791 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO2P25791 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO2P25791 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO2P25791 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO2P25791 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO2P25791 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO2P25791 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO2P25791 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO2P25791 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO2P25791 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO2P25791 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO2P25791 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO2P25791 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO2P25791 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO2P25791 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO2P25791 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO2P25791 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO2P25791 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO2P25791 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms