Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LMNB1P20700 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms