Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNA2P20248 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms