Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDCP19113 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDCP19113 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDCP19113 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDCP19113 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDCP19113 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms