Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms