Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP3P12645 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP3P12645 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMP3P12645 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BMP3P12645 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms