Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms