Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C8orf88P0DMB2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms