Protein–RNA interactions for Protein: P08253

MMP2, 72 kDa type IV collagenase, humanhuman

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP2P08253 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP2P08253 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP2P08253 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP2P08253 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP2P08253 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP2P08253 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP2P08253 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP2P08253 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP2P08253 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP2P08253 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP2P08253 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP2P08253 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP2P08253 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP2P08253 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP2P08253 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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