Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSLP07711 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSLP07711 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSLP07711 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSLP07711 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSLP07711 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms