Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFLP07196 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFLP07196 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFLP07196 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFLP07196 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFLP07196 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFLP07196 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFLP07196 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFLP07196 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFLP07196 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFLP07196 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFLP07196 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFLP07196 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFLP07196 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFLP07196 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFLP07196 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFLP07196 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFLP07196 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFLP07196 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFLP07196 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFLP07196 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFLP07196 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFLP07196 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFLP07196 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFLP07196 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFLP07196 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms