Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms