Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNSO60931 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTNSO60931 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms