Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSI1O43347 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSI1O43347 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSI1O43347 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSI1O43347 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MSI1O43347 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSI1O43347 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSI1O43347 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSI1O43347 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSI1O43347 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSI1O43347 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSI1O43347 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSI1O43347 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSI1O43347 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSI1O43347 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSI1O43347 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSI1O43347 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSI1O43347 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSI1O43347 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSI1O43347 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MSI1O43347 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms