Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ZNF208O43345 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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ZNF208O43345 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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ZNF208O43345 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF208O43345 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF208O43345 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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ZNF208O43345 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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ZNF208O43345 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF208O43345 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF208O43345 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF208O43345 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF208O43345 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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ZNF208O43345 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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ZNF208O43345 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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ZNF208O43345 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF208O43345 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF208O43345 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF208O43345 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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