Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CEP290O15078 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP290O15078 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP290O15078 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP290O15078 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP290O15078 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP290O15078 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP290O15078 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP290O15078 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP290O15078 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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CEP290O15078 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CEP290O15078 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CEP290O15078 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CEP290O15078 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP290O15078 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP290O15078 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP290O15078 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CEP290O15078 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP290O15078 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP290O15078 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP290O15078 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CEP290O15078 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CEP290O15078 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEP290O15078 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CEP290O15078 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CEP290O15078 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CEP290O15078 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CEP290O15078 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP290O15078 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP290O15078 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP290O15078 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP290O15078 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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